画像をpdfファイルで指定したとき，bounding box に関し，以下の設定になっていれば，…bb ファイルがないと言われることはないはず

graphicx 読込み時に，ドライバに dvipdfmx が指定されている (dvipdfm ではダメ): \usepackage[dvipdfmx]{graphicx}

Beamer の場合には，\documentclass[uplatex,dvipdfmx]{beamer}

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